今回はbin配布のようです、
昔はソースでしか配布していなかった記憶が・・・
とりあえずDLして解凍。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src#
debian-x:/usr/local/src# tar zxvf mysql-5.0.67-linux-i686.tar.gz
･
･
debian-x:/usr/local/src#
----------------------------------------

INSTALL-BINARYに従い作業を進めます、
ユーザを追加し、パスワードを設定。
----------------------------------------
debian-x:~#
debian-x:~# groupadd mysql
debian-x:~#
debian-x:~# useradd -g mysql -d /usr/local/mysql mysql
debian-x:~#
debian-x:~# passwd mysql
Enter new UNIX password:
Retype new UNIX password:
passwd: password updated successfully
debian-x:~#
----------------------------------------

バージョン変更の際、管理を省力化する為、
リンクを作成します。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src#
debian-x:/usr/local/src# ln -s mysql-5.0.67-linux-i686 mysql
debian-x:/usr/local/src#
debian-x:/usr/local/src# ls
httpd-2.2.9         mysql-5.0.67-linux-i686         php-5.2.6.tar.gz
httpd-2.2.9.tar.gz  mysql-5.0.67-linux-i686.tar.gz
mysql               php-5.2.6
debian-x:/usr/local/src#
----------------------------------------

所有権を変更。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src#
debian-x:/usr/local/src# cd mysql
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# chown -R mysql .
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# chgrp -R mysql .
debian-x:/usr/local/src/mysql#
----------------------------------------

データベースを初期化します。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# scripts/mysql_install_db --user=mysql
debian-x:/usr/local/src/mysql#
----------------------------------------

再度、所有権を変更、
マニュアル通りです・・・。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# chown -R root .
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# chown -R mysql data
debian-x:/usr/local/src/mysql#
----------------------------------------

実行します、
後で自動起動するサービスとする予定です。
----------------------------------------
debian-x:/usr/local/src/mysql#
debian-x:/usr/local/src/mysql# bin/mysqld_safe --user=mysql &
[1] 14221
debian-x:/usr/local/src/mysql# Starting mysqld daemon with databases from /usr/local/src/mysql/data

----------------------------------------

別にターミナルエミュを起動し
DBテーブルを表示させました、
動作確認OKです！
----------------------------------------
debian-x:~#
debian-x:~# /usr/local/src/mysql/bin/mysqlshow
+--------------------+
|     Databases      |
+--------------------+
| information_schema |
| mysql              |
| test               |
+--------------------+
debian-x:~#
----------------------------------------